植物抗逆整合生物学课题组主要借助蛋白质组学和分子生物学等研究技术，研究聚焦于天然橡胶生物合成调控的蛋白质化学基础和盐生植物耐盐的分子机制两个主要方向。为了继续展开热带植物蛋白质组研究，王旭初研究员首先对热带植物蛋白质组研究体系进行了优化改进，发现高温变性是严重影响热带地区开展2-DE的关键因素（Xuchu Wang* et al. 2011, Electrophoresis 32, 348-356）。

 通过对考马斯亮蓝染色技术的系统性比较，优化改进了一种CBB G250染色技术（Xuchu Wang* et al. 2012, Electrophoresis 33, 296-306），已经广泛应用在蛋白质组研究中。在此基础上，继续开展植物抗盐的分子机理研究。通过比较不同盐离子对海马齿生长的影响，发现钠离子比钾离子和氯离子更能促进盐生植物生长发育（Dongyang Wang et al. Xuchu Wang* 2012, Plant Physiology and Biochemistry 51, 53-62）。

对其进一步展开蛋白质组研究发现，300 mM氯化钠是海马齿生长发育的最佳盐分条件，海马齿主要通过激活液泡膜上的V-ATP酶来达到极端耐盐性（Xiaoping Yi et al. Xuchu Wang* 2014, Journal of Proteomics 99: 84-100）。为了深入揭示耐盐模式植物盐芥的抗盐机制，  植物抗逆整合生物学课题组利用蛋白质组和转录组学技术，对不同盐分处理条件下的盐芥叶片进行了深入研究，发现淀粉，可溶性糖和脯氨酸的积累，结合钠离子在植物液泡中的区隔化作用，共同保持植物细胞的渗透平衡，从而使盐芥具有很强的耐盐性，该部分研究结果已经发表于国际蛋白质组研究领域的顶级期刊Mol Cell Proteomics（Xuchu Wang* et al. 2013, Molecular and Cellular Proteomics 12, 2174-2195），引起了国内外同行的广泛关注，两年之内已经被引用15次。在此基础上，还对盐芥叶绿体应答盐胁迫的蛋白质组变化进行了研究，通过拟南芥转基因实验证实，甘油醛-3-磷酸脱氢酶的β亚基在盐生植物抗盐应答中起关键调控作用（Chang LL et al. Xuchu Wang* 2015, Plant Science 2015, 236, 223-238）。这些研究成果对于进一步理解植物耐盐的机制必将起到更好的促进作用。