本发明公开了一种快速高效获得木薯体细胞胚的方法。该方法能够大量快速去除非胚性愈伤组织，将体胚块周围的非胚性愈伤组织清除干净，特别适用于需要获得大量体细胞胚的实验。同时，该方法不仅减少了人工用拨针剥离过程中对体细胞胚的损伤，而且还极大缩短了人工剥离非胚性愈伤组织所花费的时间，大幅度提高了实验的效率。与仅采用拨针手工剥离相比，采用本发明的方法对非胚性愈伤组织的剥离更彻底。