本发明提供了一种微生物生防菌制剂，所述微生物生防菌制剂为液体，其有效成分由长枝木霉菌及其发酵代谢产物、解淀粉芽孢杆菌及其发酵代谢产物、沼泽红假单胞菌及其发酵代谢产物、小柴胡碱和壳聚糖组成，并且所述微生物生防菌制剂中小柴胡碱的浓度为0.1‑0.8wt％，壳聚糖的浓度为0.5‑1wt％，长枝木霉菌、解淀粉芽孢杆菌和沼泽红假单胞菌的总活菌数≥5×107cfu/ml。本发明有效成分属于不同作用机理的活性成分，协同作用下对茶轮斑病防效更好，且各组分均属于绿色的、环境友好的、无毒害的、兼有药效和肥效双重生物调节功能的活性成分。