本发明公开了一种从拟南芥中分离的AtPED2基因及其制备方法和应用，该AtPED2基因的序列为SEQ?ID?No.1所示的核苷酸序列，或者是SEQ?ID?No.1所示的核苷酸序列经核苷酸添加、删除、替换、修饰的保守性突变而获得的保守性变异体。本发明首次通过基因工程技术提高AtPED2基因的表达，发现其能够增强植物对干旱胁迫的抗性，因此可作为基因工程的候选基因用于分子育种。