本发明涉及医疗检测设备技术领域，特指一种检测幽门螺旋杆菌的碳纳米管传感器及其检测方法，二氧化硅衬底、压电材料薄层、二氧化硅层、碳纳米管，二氧化硅衬底、压电材料薄层、二氧化硅层、碳纳米管依次贴合固定，压电材料薄层基板形成用于测试电势差的空间区域、中间区域。可以实时高效检测碳同位素气体分子12CO2和14CO2的含量，且保证低功耗运行，吸附12CO2和14CO2的能力相同，即相同质量的碳纳米管可以吸附的分子数一样，所以吸附12CO2和14CO2引起的质量差仅是由于同位素的质量差，然后应用压电材料的压电效应来检测其微小质量变化引起的电势改变，从而达到检测12CO2和14CO2含量的目的。该设备可以提高检测灵敏度，便携，低成本。