本发明公开了MSH2抑制剂在制备逆转MTX耐药肿瘤细胞耐药性的药物中的应用，属于医药技术领域。本发明针对MTX耐药且DHFR基因高度扩增的恶性肿瘤细胞，以MSH2为靶点，抑制DSBs的修复，减少DMs和HSRs的形成；同时使含有DHFR扩增基因的微芽/微核形成增多，导致细胞内DHFR基因剂量减少，使细胞对MTX的耐药能力降低，进而逆转MTX耐药肿瘤细胞的耐药情况，提高肿瘤治疗的效率。本发明为MTX作为主要治疗药物且易产生耐药性的恶性肿瘤的生物治疗提供新的靶向性治疗方案，为有效地对抗MTX耐药提供了科学的依据。此外，本发明对于深入了解化疗耐药的本质以及寻找个体化治疗的耐药靶点也具有非常积极的意义。