本发明公开了一种含紫草素的微乳及其制备方法。所述的微乳由以下原料按重量比配制而成：紫草素0.015％～0.3％、乳化剂2～18％、助乳化剂3～15％、油相5～20％、水相50～78％。本发明具体制备方法如下：(1)称取乳化剂和助乳化剂，搅拌使之混合均匀；(2)再加入油相，搅拌均匀；(3)加入紫草素，搅拌至其完全溶解，得混合液；(4)用均质机对混合液均质，得均质液；(5)去离子水加入均质液中，搅拌至体系透明澄清。本发明克服了紫草素在水性制剂中溶解度极低、稳定性差的缺点，制备的紫草素微乳透明度好，并且具有良好的稳定性和透皮吸收性。