本发明涉及微生物共生培养领域，具体而言，提供了一种基于SOD的复合微生物共生诱导培养技术和微生物共生培养菌剂及其应用。本发明提供的微生物共生培养的诱导方法，根据目标菌株对氧含量的需求进行分类，先将需氧量接近的菌株合并培养得到若干个菌株组，从需氧量最低的菌株组开始共生培养的诱导，通过保证体系中生物活性超氧化物歧化酶的量和逐渐提高培养条件中的氧气含量来提升体系的适应性，当氧含量到达一定浓度时，加入氧含量需求相近的菌株组，再通过保证体系中超氧化物歧化酶的量和逐渐提高培养条件中的氧气含量来提升体系对更多氧气含量的适应性，重复上述的操作，直至所有菌株组共生培养完成，得到微生物共生培养菌剂。