本发明涉及生物医药领域，具体提供了一种CTLA4‑Ig融合蛋白的纯化方法，所述纯化方法包括：发酵液预处理、亲和层析及复合型阴离子交换层析。本发明提供的方法通过亲和层析和复合型阴离子交换层析两步即可完成对CTLA4‑Ig融合蛋白的纯化，而且能够兼顾活性、纯度、得率三个维度，亲和层析用于捕获融合蛋白，复合型阴离子交换层析用于精细纯化蛋白，最终获得质量合格的CTLA4‑Ig融合蛋白，该方法相对现有技术提供的纯化方法而言，简化了纯化工艺，缩短了纯化时间，在最适宜的实验条件下结合实验操作方法获得了产率较高的活性融合蛋白，大大节省了纯化成本。