本发明涉及一种具有抗菌活性的化合物及其制备方法与应用，所述具有抗菌活性的化合物的化学结构式如式I所示：本发明首次由解淀粉芽孢杆菌CGMCC1.936的发酵液中提取出一种具有抗菌活性的糖苷类化合物，该化合物具有很强的抑制致病菌的作用，且采用微生物发酵制备生产周期短、产物稳定、含量高，该化合物可广泛应用于农药、医药、保健品及化妆品生产中。