本实用新型涉及一种多层培养皿，包括培养皿本体，在所述培养皿本体内部设置多个上下平行间隔的培养板，所述培养板在竖直方向上交错排列，与培养皿本体侧壁留有间隙的培养板端部向上延伸形成溢流挡板，所述培养皿本体上端设置有开口，在开口处粘结可掀开的透气膜，所述透气膜将培养皿本体上端开口封盖，在所述培养皿本体上还设有用于加液的加液口与用于移液的移液口，所述加液口位于最上层培养板的上方，用于向最上层培养板上方加注液体，所述移液口位于最下层培养板下方，用于从最下层培养板下方移出液体。与现有技术相比，本实用新型培养皿结构设置简单，成本低，可批量化生产，方便使用，能够避免交叉感染，节约培养成本。