本发明涉及一种通过添加混合镁盐提高赤藓糖醇转化率的方法。该方法先进行解脂假丝酵母菌种子液的培养，再对解脂假丝酵母菌种子液进行发酵培养，制得赤藓糖醇。其中，发酵培养基的组分为：葡萄糖0.3～0.35kg/L、有机氮源4～7g/L、无机盐5～6g/L。本方法通过对发酵培养基部分原料替代、由添加单一镁盐改为混合镁盐并调整混合镁盐的比例优化发酵培养基，使其菌种代谢途径更利于生成赤藓糖醇，从而有效地提高赤藓糖醇转化率。