本发明提供了一种噻嗪荧光衍生物的制备方法及其应用，属于抗肿瘤药物领域。它解决了诱导肿瘤细胞凋亡、诱导癌细胞线粒体膜电势坍塌以及提高癌细胞内活性氧水平的技术问题。一种噻嗪荧光衍生物的制备方法及其应用，包括化合物1、化合物2和化合物3，对噻嗪类分子进行修饰，得到一类新型荧光可视的线粒体靶向抗肿瘤先导化合物。本发明有较好的荧光特性、线粒体靶向性以及较高的生物活性的优点。