本发明公开了一种低粘度高持水性琼脂的生产工艺。包括如下步骤：江蓠菜经除杂洗净后，加水浸泡，调节pH值4.0~6.0，调节水温45~50℃，加入复合酶处理1~3 h，倾去酶液，漂洗；加水适量，然后加入乙二胺四乙酸二钠，用酸调节pH值3~5，然后加入过氧化氢溶液适量，处理0.5~2 h，过滤，漂洗至中性；加入漂白水处理20~60 min，过滤，漂洗至中性；加水适量，常压下保持沸腾至江蓠菜完全融化，过滤去渣；胶液迅速冷却、推条、分装、油压脱水，烘干、粉碎，过筛，收集粉末。本发明获得的琼脂，具有低强度、低粘度、高持水性等特点。