本发明公开了一种提高海参补肾壮阳功效的方法，属于海洋生物技术领域。以海参深加工废弃物海参内脏为原料，集成现代生物分离技术、生物酶解技术、混菌微生物发酵技术，研制开发出显著补肾壮阳功效的海参多肽生物制品，其中混菌好氧发酵菌种主要包括富硒酿酒酵母、枯草芽孢杆菌和地衣芽孢杆菌。所得海参多肽具有较强的抗氧化能力，提取液可根据应用途径做浓缩、吸附干燥、醇析或树脂纯化等处理，满足在保健、食品、医药等领域的高效利用。该工艺技术简单高效、所得产品抗氧化能力和补肾壮阳功效强，产品稳定性强，生产成本低，易于工业化规模生产。