本发明公开了一种标准化少棘巨蜈蚣人工养殖系统及养殖方法。所述的养殖系统包括以下功能区：饲养区、辅助饲养区、管理区、废物处理区、仓库等，饲养区外设有防逃水沟以防止蜈蚣逃走和保护蜈蚣不受天敌侵袭；饲养区内有标准养殖池，每个养殖池内再由光滑玻璃隔成各个区域，每个区域地下部分均铺设有采用水泥浇灌而成的“鸡蛋托状养殖模具”，地上有独立喂食槽，每日傍晚将新鲜事物固定于喂食槽内，以避免因食物霉变引起的细菌、真菌性疾病的威胁；本发明极大的提高了人工养殖蜈蚣的养殖效率和蜈蚣药材质量的稳定性，对确保蜈蚣中药材的合理应用和缓解野生蜈蚣资源减少的现象有重要意义，同时整个发明具有可复制性，能满足工厂标准化养殖生产。