本发明公开了一种在重组宿主中生产甜菊醇糖苷的方法，包括以下步骤：选材、提取、分离、纯化和混合五到工序进行在重组宿主中生产甜菊醇糖苷，使得甜菊醇糖苷安全性高，经国内外药理实验证明，甜菊糖甙为非致癌性物质，无毒无副作用，食用安全。甜叶菊原产地南美巴拉圭、巴西等地的居民食用甜叶菊已有四百多年历史，至今未发现有任何毒害，低热值，可应用于低热量食品、饮料和医药。长期食用甜菊糖甙不会使人发胖，且有降血糖、防龋齿、健胃、解除疲劳之功能，并对健美减肥和糖尿病、心脏病、高血压、动脉硬化等患者食用有辅助疗效，是制作保健食品、保健饮料、保健化妆品和医药制品等最佳天然甜味剂。