本发明公开一种基于双水相生物矿化技术制备可调药物释放率的碳酸钙/海藻酸钙复合微球及其制备方法，属高分子材料及控释药物载体领域。本发明所述的制备方法，操作简单，耗能低，且体系温和无毒；利用双水相对大分子蛋白质的选择性分配特性，可将大分子蛋白质类药物很好地保留在双水相液滴模板的内相中，在固化时极好地被包封在复合海藻酸钙微球的内部，对蛋白质类药物具有优良的包封率；而且可通过调节体系的脲酶浓度，制备不同复合程度的碳酸钙/海藻酸钙微球，进而可控制包埋其中的药物的释放速率；克服了传统复合海藻酸钙微球网络孔隙较大，包载物易流出的缺点。可广泛拓展其在生物医疗、化妆品行业、食品行业以及酶工程等领域的应用。