本发明公开了一种治疗便秘及消化不良的益生元多肽复合益生菌，其包括：甘露糖醇1‑2份、西红柿籽粉12‑20份、陈皮5‑6份、低聚木糖3‑5份、小苏打0.2‑0.3份、甘草8‑10份、苦瓜肽粉12‑18份、罗伊氏乳杆菌0.3‑0.5份、葵花籽油2‑3份、嗜酸乳杆菌0.2‑0.3份、干酪乳杆菌0.3‑0.5份、乳酸乳杆菌0.4‑0.5份、乳链球菌0.2‑0.3份、保加利亚乳杆菌0.2‑0.3份、炒麦芽3‑5份、枳实3‑5份。其具有丰富的膳食纤维(如综合果蔬粉等等)、苦瓜肽粉等降血糖、血脂成分以及嗜热链球菌等多种益生菌，通过合理的复配使用后能够充分促进肠道吸收，增加胃肠动力，润肠通便。