本实用新型提供一种模块化袋进袋出过滤器装置，包括从左到右依次设置的均流模块、过滤模块和扫描模块，均流模块包括均流段箱体，过滤模块包括过滤段箱体，扫描模块包括扫描段箱体，均流段箱体的两端、过滤段箱体的两端、扫描段箱体的两端分别设有连接法兰，均流段箱体与过滤段箱体、过滤段箱体与扫描段箱体分别通过连接法兰和紧固螺栓可拆卸地连接。本实用新型采用模块化设计，能够根据应用场景合理地自由搭配各段箱体或增减箱体，提高设备的使用灵活性；提高运输便利性，节约更换成本及更换时间；夹紧装置中采用棘轮限位机构进行限位，防止夹紧装置松脱；设置实时消毒检测阀，方便技术人员实时、安全地取出指示剂进行检测。