本发明公开了一种无毒环保溶剂型双层纳米纤维皮肤敷料及其制备方法。所述敷料包括载药亲水修复天然聚合物纤维层及防水透气合成聚合物纤维层；采用无毒环保溶剂体系，通过静电纺丝技术逐层制备。制备方法为：将天然聚合物和药物溶解于无毒环保溶剂中，加入交联剂；将合成聚合物溶解于无毒环保溶剂中，加入疏水剂；将天然聚合物溶液、合成聚合物溶液分别置于注射器中，采用静电纺丝装置进行纺丝制成双层纤维膜。本发明制备的双层纳米纤维敷料不含有毒溶剂，作为敷料不会对开放型伤口产生毒副作用；双层纳米纤维敷料具有防水透气性能，细胞相容性好，可促进皮肤损伤大鼠伤口愈合，在皮肤敷料领域具有巨大应用前景。