本发明公开了一种高纯度白色纳他霉素的制备方法，取纳他霉素离心液用水配成25‑35g/L，加入NaOH调节pH至11.7，充分搅拌溶解，在此溶液中加入占总质量1%‑4%的碳酸钠，搅拌10‑30min，过滤，在滤液中加入0.1‑2mol/L的柠檬酸，第一次调节pH至10.5‑9.0，搅拌20min，再用0.1‑2mol/L的柠檬酸将pH调至6.5，抽滤，洗涤，干燥得到纳他霉素最终产品。通过本发明制得的纳他霉素纯度大于98%，颜色白，收率可达到90%，工艺成本低。